
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物技术 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科学研究但是
探析师研究根据冷冻箱周期加长羊肉的密度、持水特性、质感度、徘徊子铁含磷量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4标准来开展肩部肌肉阻止上皮细胞膜的铁去世状态下。但是显现,冷冻箱周期加长后,羊肉的密度在第四天和第6天明显急剧下降;持水特性降低;彩色变深,损失质感,鲜朱蓝色变的暗朱蓝色。还有就是,徘徊子铁、几丁质酶氧和MDA的含磷量明显增长,上皮细胞膜凋亡率明显变高。 探析拜谱生物截取区别冷冻冷藏时间间隔的肌肤供试品的球脂肪酸,最后开始SDS-PAGE数据定性分析,球脂肪酸条带在区别五代十国时期分布图制作饱满且相类似(图1a)。跟据球球淀粉酶在区别供试品中的表现状态,数据定性分析挖掘指定组供试品的中六位数比较敏感于指定程度(图1b),解释肌肤供试品球脂肪酸具备着优质的组内相类似性和组间差情人性。 营养素质酶酶质组学共判定会出1996种营养素质酶酶质。以B0为相较比较组,筛分B1、B2、B4和B6中的营养素质酶酶完成距离把你想表达出出来爱定性浅析,共判定会到377个DEPs。将火山图web3d,并会根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两位标准规定定性浅析DEP。成果如图是1c-f如下图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别判定会出22、33、73和140个DEPs,里面分发型别上涨6、11、32和87个,调整16、22、41和53个。聚类分析策略评估方法了有的差异保温时期肌肉组织群聚集中营养素质酶酶质的把你想表达出出来爱,成果表现肌肉组织群营养素质酶酶把你想表达出出来爱距离时期推移保管时期的提升而提升(图1g)。
图1| 有所差异冷藏箱期限的背部肌肉备样血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一保鲜冷库时间段的身体肌肉试品距离蛋白酶了解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁生亡蛋清肽的PRM降钙素原检测概述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 应用于KEGG生物富集不同体现核蛋白的铁消失管理机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱怪物提供了TMT按量核营养素组学能力功能,拜谱生物体已生产研发达成并建立起了加强比较成熟的转录组学、核核蛋白组学、细胞代谢组学与两组学合作车辆能力功能系统,欢迎致电咨询!
参看医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.