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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于免疫抗体种类非特异朋友、寡核苷酸呈现投入高出平常许多的或作业环节有难度。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯副教授拜谱生物在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个成本低预算、跨种群、全app兼容的全新解决方案。

杂志简洁

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国内地理学的分析方案院隐性基因病与成长海洋海洋生物制品学分析方案所和国内隐性基因病都了解主办单位的国际级学术界交流杂志学术期刊论文论文,着力推进于报道范文宝宝地理学的分析方案和医疗隐性基因病学业务教育方面的原创内容性分析方案工作成效。JGG 202多年度影向因素7.1,Scopus学术界交流杂志学术期刊论文论文评判指数公式CiteScore 9.9,榜排JCR 202多年度GENETICS & HEREDITY业务教育方面Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY业务教育方面Q1区,榜排国内地理学的分析方案院杂志学术期刊论文论文设计布局海洋海洋生物制品学类项1区(Top杂志学术期刊论文论文),隐性基因病学和生化模式与原子海洋海洋生物制品学小类双1区。

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那些是HEATag

委婉的“二合二为一”开发

HEATag是由凝集素和HUH内切酶涉及的融为一体核蛋白

「位置定位器」引擎 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化呈现(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「连接方式器」方案 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)字段条型码来进行共价连接方式。

“1+1>2”的特效:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样品图标与产品追溯。

Fig1: HEATag多厚标出机制表示图

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操作检则

HEATag真的有可以打?

能否在各个必要条件下,控制喂奶软体动物神经肿瘤细胞系单神经肿瘤细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。深入分析微商团队为 HEATag 设有了多轮 “重压检验”,从細胞系到細胞核,从常温状态到温度低,从新鲜范本到稳固范本,全多方面检验它的安全稳定性能性处理和性能性。

首轮检验涉及喂乳两栖动物癌细胞膜核系:的研究员工选取了出于人、鼠、仓鼠八个种类的五种癌细胞膜核(HEK293T、K562、MEF、CHO),在环境温度下能 HEATag 图标后结合测序。结果英文回收处理的 11447 个癌细胞膜核中,85.66% 都能使用 HEATag 条型码较准不对到原种类,模板间交叉点被污染稀少,UMAP 聚类算法解析还随时单位证明,HEATag 条型码与种类特情人dna组特证间距不对。 完了,测试软件的情况进一点升到:研究方案的人员体验在 4℃下标上符号鲜新細胞、在室内温度下标上符号甲醇统一細胞,竟然随便标上符号細胞核。后果即使全场最佳:所有的的情况下,模本标贴与鱼类信息内容均更具好的相应的性,分割正确率超 95%。倘若甲醇统一会造成较轻的转录本穿插水污染,細胞核配制会出极少量 RNA 减少,細胞类别的参考文献标注后果即使与鲜新模本维持相同,证实 HEATag 就可以标上符号多种工作的情况下的科学实验模本。

Fig2: HEATag 可在多种条件下实现单体细胞转录组混样具体分析

够标上母乳喂奶動物和海洋资源无脊椎骨動物的原代生殖细胞

要说进行系测试测试是 “知识基础题”,那进行子样品就会 “增添题”, 这种子样品之所以因进行类型、非常复杂、环镜适用性特异,变成标识枝术的 “重疑难问题”,而 HEATag 恰恰舞在这种 “重疑难问题” 上显现了主要优势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸团体,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞这不仅能被最准确判别,全部基本肿瘤细胞种类的聚类分析法然而都清析可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海域生物工程的适用性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 条型码与鱼类转录组包括较高保持完整性,是没有影响因高盐氛围影响的 “标记符号没用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可建立辅乳昆虫组织性样本量多个 scRNA-seq 研究分析

Fig4: HEATag可变现新鲜的海上无脊柱昆虫强有力的加密管控 scRNA-seq 浅析

HEATag与上皮细胞的联系不易进而引发转录组的相关系数该变

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在达成标记图片钓鱼任务的同一,不要对之后的转录混合物析会导致干忧,保持了科研资料的真實性。

Fig5: HEATag不易关系范本的 RNA 表示玩法

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的前景可期

HEATag 能为单神经细胞探究引发任何?

HEATag 的社会价值,远只有于 “解決标志疑问”,它的智能化性和共通性,将要为单组织科学研究使用 更加可能会性

从应该用场地了解

HEATag 能遮盖从 “简单的较好分享”(如癌拜谱生物与很正常拜谱生物、药物治疗治疗与照表)到 “大大小设计”(如拜谱生物内部图谱生成、高通骁龙量选择)的全规模化所需。如今 PIP-seq、Stereo-cell 等当下可初始化新技术的成长 ,HEATag 还能进1步不断提升单内部设计的通量,转向科研管理拜谱生物做好挺大大小的顶目。

从跨前沿技术提升空间了解

HEATag 这样不仅适用性于转录组学,还能与表观遗传基因组学、蛋清质组学、空间组学等技能相结合,进行个人定制目录和寡核苷酸字段,HEATag 可能便捷融于有差异 的组学具体步骤,不引响数据信息抓取层次。同時,通过HEATag还可能快速发展单細胞糖组学学习技能。

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合作方式动态性

拜谱怪物与陈凯专家教授已达成第一次协议想法

值得购买瞩目的是,在 HEATag 方法表显出较大选用竟争力的背景图下,拜谱微微生态学已与男方海域科学性与公程惠州市实验设计报告室(武汉)陈凯老师获得系统化配合相关。另一方筹划致力于 HEATag 方法的房产化着地、科学课题转为等走向拉开深入操作,带动这个低生产成本、跨鱼类的单受损受损上皮细胞记号方法快速选用于具体科学课题消费场景,为更好实验设计报告室提供了高效率、实惠的单受损受损上皮细胞研究方案平台,保驾护航科学课题业务者在受损受损上皮细胞微微生态学、海域微微生态学、肠道疾病策略等邻域完成更好超越
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