
近日,武汉医科大时一号附屬宠物医院王学浩院土技术团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶点卡路里排泄检测分析服务。
英文音标一级标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕标题格式:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
业主厂家:南京医科大学
探讨材质:细胞
拜谱能提供功能:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向药物力量分解代谢组
能力交通路线:
探讨导致
01、YBX1被检测为HCC中糖酵解的重中之重染色体
本探讨获取HCC淋巴良性淋巴淋巴肿瘤样品(n=7)的单血受损细胞膜RNA测序数据信息源集做出剖析,表明糖酵解活性酶常见分布在淋巴良性淋巴淋巴肿瘤血受损细胞膜中,hdWGCNA剖析辨认出9个什么是基因传感器(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的经营剖析判别YBX1为自主经营危险问题问题(图1H)。进每一步紧密结合IHC、WB实验报告和淋巴良性淋巴淋巴肿瘤公司与紧邻非淋巴良性淋巴淋巴肿瘤公司的办公空间转录组学数据信息源集印证YBX1是肝血受损细胞膜癌的治疗的潜在性的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被选定为调低HCC血细胞糖酵解的要素原因
02、YBX1增进HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物能量是什么代谢率组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1加速HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1构建并促使YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,淀粉酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1相结合并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增加其磷酸性反应,得以增进其核转位
进那步查重YBX1的O-GlcNAc糖基化是否有决定其磷过酸,在OGT敲低的HCC肿瘤血细胞中或用OGT限溶液剂OSMI-1解决,YBX1淀粉酶能力明显大幅度降低,YBX1磷过酸明显变少(图4A-C)。IP實驗展示,在一致的Flag-YBX1底物能力下,YBX1-WT的磷过酸能力明显过于YBX1-T57A,体现了磷过酸的上升不止仅是这是由于高的YBX1淀粉酶展示(图4D)。分离出来了核和质多组分看到了TMG解决的HCC肿瘤血细胞中YBX1核展示的身高(图4E-F),进那步看到了YBX1磷过酸的重点缓解指数公式是AKT(图4G-I)。等看到了突出O-GlcNAc糖基化利用力促其磷过酸来怎强YBX1淀粉酶稳定的性并力促核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 绘制益于于其进一歩造成磷碱化绘制并能够推动其核转位
05、YBX1提高PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1推进PKM2转录
06、YBX1 是可以增加组蛋白酶乳硝化作用遮盖横向
科研察觉YBX1敲低正相关减低营养素质乳硝化成用,尤其要是H3K18乳硝化成用(图6A-C)。糖酵解减弱剂2-DG的實驗验证了糖酵解与组营养素乳硝化成用的可以锁定,减弱糖酵解可正相关减低H3K18la的水平(图6D)。PKM2过表达出来爱可逆反应转YBX1敲低造成的H3K18la下滑,以外源乳酸治理 既改善H3K18la,还存于YBX1表达出来爱上浮,提升会存在单向评议(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR验证,H3K18la利用聚集于YBX1加载子可以使得其转录,该的过程受O-GlcNAc糖基化房产调控(图6H-J),并察觉P300 上浮是YBX1促进H3K18乳酰化成用的逻辑(图6K-L)。
图6.YBX1增强学习H3K18乳酸性反应体现层次
内容工作小结
在一些研究探讨中有关资料了YBX1在HCC中高把你想表达出来出来,同时与糖酵破解切相应的。YBX1在T57处被O-GlcNAc遮盖,若想不稳定性淀粉酶酶质并减弱其把你想表达出来出来。一些遮盖还利于YBX1在T57处的磷酸性反应,利于其核易位。故而,这个期间减弱了糖酵解相应的什么是遗传基因的转录并促进乳酸的行成。然而,YBX1激话P300的转录,必将驱动包组淀粉酶酶的乳酸性反应,非常是H3K18la,H3K18乳酸性反应领域调节作用YBX1什么是遗传基因转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隐性基因双面馈环制度图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物技术为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶点势能分泌组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、翻译资料后装饰组学、新陈代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
借鉴文献资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.